Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uso1Q9Z1Z0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uso1Q9Z1Z0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Uso1Q9Z1Z0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uso1Q9Z1Z0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uso1Q9Z1Z0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uso1Q9Z1Z0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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