Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms