Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms