Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J3

Nfs1, Cysteine desulfurase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfs1Q9Z1J3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nfs1Q9Z1J3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms