Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmg20bQ9Z104 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms