Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup160Q9Z0W3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup160Q9Z0W3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms