Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Cldn9Q9Z0S7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Cldn9Q9Z0S7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cldn9Q9Z0S7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cldn9Q9Z0S7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cldn9Q9Z0S7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cldn9Q9Z0S7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cldn9Q9Z0S7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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