Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn3Q9Z0G9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms