Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin2Q9WVE8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms