Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUE3

Cyb561d2, Cytochrome b561 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d2Q9WUE3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyb561d2Q9WUE3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyb561d2Q9WUE3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms