Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf13bQ9WU72 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms