Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU39

Scnn1g, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1gQ9WU39 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Scnn1gQ9WU39 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Scnn1gQ9WU39 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Scnn1gQ9WU39 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Scnn1gQ9WU39 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Scnn1gQ9WU39 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scnn1gQ9WU39 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Scnn1gQ9WU39 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Scnn1gQ9WU39 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Scnn1gQ9WU39 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scnn1gQ9WU39 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Scnn1gQ9WU39 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scnn1gQ9WU39 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scnn1gQ9WU39 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scnn1gQ9WU39 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scnn1gQ9WU39 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scnn1gQ9WU39 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scnn1gQ9WU39 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scnn1gQ9WU39 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scnn1gQ9WU39 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scnn1gQ9WU39 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Scnn1gQ9WU39 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scnn1gQ9WU39 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scnn1gQ9WU39 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scnn1gQ9WU39 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scnn1gQ9WU39 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scnn1gQ9WU39 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Scnn1gQ9WU39 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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