Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scnn1bQ9WU38 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms