Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1W3

Rnf103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf103Q9R1W3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf103Q9R1W3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms