Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms