Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plod1Q9R0E2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms