Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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Nek3Q9R0A5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Nek3Q9R0A5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Nek3Q9R0A5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek3Q9R0A5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms