Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf4Q9QZS2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf4Q9QZS2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf4Q9QZS2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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