Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col4a4Q9QZR9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms