Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms