Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gpc1Q9QZF2 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gpc1Q9QZF2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gpc1Q9QZF2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gpc1Q9QZF2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gpc1Q9QZF2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gpc1Q9QZF2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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