Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ15

Clec4a, C-type lectin domain family 4 member A, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4aQ9QZ15 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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Clec4aQ9QZ15 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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Clec4aQ9QZ15 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Clec4aQ9QZ15 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Clec4aQ9QZ15 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4aQ9QZ15 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Clec4aQ9QZ15 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4aQ9QZ15 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4aQ9QZ15 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4aQ9QZ15 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4aQ9QZ15 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4aQ9QZ15 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4aQ9QZ15 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4aQ9QZ15 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4aQ9QZ15 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4aQ9QZ15 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4aQ9QZ15 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4aQ9QZ15 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4aQ9QZ15 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4aQ9QZ15 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4aQ9QZ15 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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