Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms