Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndrg3Q9QYF9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndrg3Q9QYF9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms