Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms