Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms