Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kcnip3Q9QXT8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms