Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Limd1Q9QXD8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms