Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc5Q9QX29 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms