Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM7

Msh5, MutS protein homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh5Q9QUM7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms