Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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