Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col5a3Q9JLI2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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