Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm1Q9JLF6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm1Q9JLF6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm1Q9JLF6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgm1Q9JLF6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgm1Q9JLF6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgm1Q9JLF6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgm1Q9JLF6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Tgm1Q9JLF6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgm1Q9JLF6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgm1Q9JLF6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgm1Q9JLF6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgm1Q9JLF6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgm1Q9JLF6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Tgm1Q9JLF6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Tgm1Q9JLF6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgm1Q9JLF6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgm1Q9JLF6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgm1Q9JLF6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgm1Q9JLF6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgm1Q9JLF6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgm1Q9JLF6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgm1Q9JLF6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgm1Q9JLF6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgm1Q9JLF6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgm1Q9JLF6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgm1Q9JLF6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgm1Q9JLF6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Tgm1Q9JLF6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgm1Q9JLF6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgm1Q9JLF6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgm1Q9JLF6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Tgm1Q9JLF6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Tgm1Q9JLF6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgm1Q9JLF6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgm1Q9JLF6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgm1Q9JLF6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Tgm1Q9JLF6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Tgm1Q9JLF6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tgm1Q9JLF6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tgm1Q9JLF6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Tgm1Q9JLF6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Tgm1Q9JLF6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms