Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rfx5Q9JL61 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx5Q9JL61 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms