Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnot9Q9JKY0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot9Q9JKY0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms