Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrac1Q9JKP8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms