Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms