Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms