Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms