Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Tuba8Q9JJZ2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Tuba8Q9JJZ2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Tuba8Q9JJZ2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Tuba8Q9JJZ2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Tuba8Q9JJZ2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Tuba8Q9JJZ2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Tuba8Q9JJZ2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Tuba8Q9JJZ2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Tuba8Q9JJZ2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Tuba8Q9JJZ2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Tuba8Q9JJZ2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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