Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scube2Q9JJS0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scube2Q9JJS0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scube2Q9JJS0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scube2Q9JJS0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms