Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG7

Caln1, Calcium-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caln1Q9JJG7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caln1Q9JJG7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms