Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF0

Prmt1, Protein arginine N-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt1Q9JIF0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prmt1Q9JIF0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms