Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms