Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms