Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Usp29Q9ES63 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Usp29Q9ES63 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Usp29Q9ES63 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Usp29Q9ES63 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Usp29Q9ES63 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Usp29Q9ES63 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Usp29Q9ES63 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Usp29Q9ES63 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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