Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hipk3Q9ERH7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms