Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snap29Q9ERB0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snap29Q9ERB0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snap29Q9ERB0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snap29Q9ERB0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snap29Q9ERB0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snap29Q9ERB0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms