Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms