Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP64

Tnmd, Tenomodulin, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnmdQ9EP64 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TnmdQ9EP64 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TnmdQ9EP64 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TnmdQ9EP64 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TnmdQ9EP64 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms